Episode 1 : Le mystère du Hornet - Ghost Ship 

Alors qu'un squelette est retrouvé à bord d'un porte-avion hors service, Harm mène l'enquête sur ce meurtre mystérieux. Il découvre alors des indices au sujet de son père disparu. 

Episode 2 : Liaison interdite - The Court Martial of Sandra Gilbert 

Une femme pilote de chasse est poursuivit pour avoir transgressé les ordres et continué à avoir une liaison avec un soldat marié. Une député se bat alors pour lui offrir un procès équitable. 

Episode 3 : Désobéissance - The Good of the Service 

Le Major Mackenzie doit poursuivre un officier qu'elle considère comme son mentor, accusé d'avoir mené une mission de sauvetage controversée en Haïti, ou des civiles ont été tués. 

Episode 4 : Loyauté - Blind Side 

Pendant une manoeuvre, l'ancien instructeur de vol de Harm et un élève ont endommagé une tour qui a tué des civils en s'écrasant. L'accident aurait peut être pû être évité. 

Episode 5 : Le roi des puces - King of Fleas 

Un ancien Marine en fauteuil roulant se rend aux bureaux du JAG pour avouer une meurtre.Il racontre uen histoire effrayante qui s'est passée lorsqu'il était prisonnier de guerre au Vietnam. 

Episode 6 : Disparu - Vanished 

Lorsqu'un jet disparait dans le triangle des Bermudes, Harm pense qu'il s'agit d'un avion volé. Mais Bud Roberts
 pense que des ovnis sont impliqués. 

Episode 7 : Imposture - Against All Ennemies 

Un avion de la Marine a abattu un avion comercial Nord Corréen accidentellement. L'équipe du JAG apprend alors qu'un espion pourrait en être le responsable. 

Episode 8 : Au nom du père - Above And Beyond 

Un officier Afro-Américain des forces spéciales de la Navy est candidat à la médaille d'honneur. Mais des informations sur son passé révèlent qu'il pourrait en être indigne.
 
Episode 9 : Impact - Impact 

Pendant que Harm et Bud enquêtent sur une mystérieuse collision en plein ciel, Harriet Sims rejoint le bureau du JAG. Et Mac est sollicitée par un cabinet d'avocats très puissants. 

Episode 10 : Le vrai coupable - People V. Rabb 

Harm est accusé d'avoir tué un Russe qui lui avait volé des documents au sujet de son père. Mac revient alors du privé pour défendre son ancien partenaire. 

Episode 11 : Sans défense - Defenseless 

Un officier Turc haut placé s'introduit chez un gradé de la Marine. Lorsqu'elle le tue par légitime défense, une histoire de complot international est révélée. 

Episode 12 : Un enfant en danger - Someone to Watch Over Annie 

Annie, la veuve du meilleur ami de Harm, affirme que son jeune fils Josh a été le témoin d'un meutre sur une base de l'armée de l'air. Commence alors une histoire d'amour entre elle et Harm. 

Episode 13 : Rancoeur - With Intent to Die 

L'Amiral Chegwidden est hanté par le suicide d'un collègue. Il soupçonne ce dernier d'avoir été assassiné lors d'une expédition. 

Episode 14 : Pour l'amour d'un fils - Father's Day 

Un conducteur de char ayant écrasé la tente de son Commandant est sur le point d'être inculpé. Mais son combat acharné pour récupérer son enfant en bas âge est révélé à la presse. 

Episode 15 : Les vieux héros ne meurent jamais - Yesterday's Heroes  

L'équipe du JAG se rend à Miami , où trois vieux marins  à la retraite ont fait sauter le yacht d'un dealer de drogue. Là-bas, Bud rencontre les parents d'Harriet. 

Episode 16 : Chantage - Chains Of Command 

Harm et Mac poursuivent un Maitre-Chef qui, pendant des années, a sexuellement harcelé des femmes à bord de son navire. L'avocat Dalton Lowne, le petit ami de Mac, assure sa défense.

Episode 17 : Traquée - The Stalker 

Après leur rupture, Dalton commence a harceler Mac. Mais lorsqu'il est tué, cette dernière continue d'être poursuivie par un autre homme. 

Episode 18 : L'école de la vie - Tiger, Tiger 

Alors que Harm emmène Josh, le fils d'Annie, en croisière pour le week-end, des terroristes cubains détournent le bateau. Pendant ce temps, Bud et Harriet se fiancent. 

Episode 19 : En mémoire de Diane - Death Watch 

Harm parle à Mac de son ancienne enquête sur le meutre de sa petite amie Diane. Il a récemment trouvé une lettre indiquant que son meurtrier  était toujours en liberté. 

Episode 20 : Imposteur - Imposter 

Un agent du gouvernement - qui se trouve être un assassin et un maitre du déguisement - envisage de se faire passer pour Harm au tribunal et de tuer le témoin principal. 

Episode 21 : L'esprit de Jimmy Blackhorse - The Return of Jimmy Blackhorse

La Marine a l'intention d'honorer la mémoire d'un indien Navajo, transmetteur de codes pendant la Seconde Guerre Mondiale. Mais lorsque sa famille est sur le point de l'enterrer, elle indique qu'il ne s'agit pas de sa dépuille. 

Episode 22 : Accrochage - Clipped Wings 

En Italie, Harm défend un pilote américain dont l'imprudence pourrait avoir tué six civils. Là-bas, il rend visite à la fille de l'Amiral Chegwidden. 

Episode 23 : Un mariage mouvementé - Wedding Bell Blues 

Tandis que le jour du mariage de Bud et Harriet approche, Bud se dispute avec son père, Harm a perdu sa tenue blanche, et la moitié du mariage finit en prison. 

Episode 24 : Jusqu'au bout du monde (part 1) - To Russia With Love 

Harm et Mac s'envolent pour Moscou pour suivre une piste indiquant que le père de Harm, porté disparu, pourrait être en Russie. 


Episode 1 : Jusqu'au bout du monde (part 2) - Gypsie Eyes 

A bord du jet qu'ils ont volé en Russie, Harm et Mac sont abattus en plein vol. Ils sont alors sauvés par un gitan et sa soeur. Ces derniers vont aider Harm à découvrir la vérité à propos de son père. 

Episode 2 : Une soirée à l'ambassade - Embassy 

En visite à l'ambassade soudanaise, Mac et Harm sont pris de court lorsque des terroristes prennent le contrôle de celle-ci. Pendant ce temps, Harriet annonce qu'elle est enceinte. 

Episode 3 : Délit d'innocence - Innocence 

Lorsqu'un Enseigne est accusé de viol sur une jeune adoslecnte au Japon, l'équipe du JAG s'envole pour Tokyo afin de le défendre, mais elle se retrouve au milieu de tensions entre les USA et le Japon. 

Episode 4 : Vendetta - Going After Francesca 

En Italie, un officier de la Navy est traduit en court martiale pour le vol de missiles Stinger, et l'Amiral Chegwidden retrouve son ex-femme après l'enlèvement de leur fille. 

Episode 5 : Les vétérans - The Martin Baker Fan Club

Roscoe, l'ancien marine en chaise roulante  qu'Harm a déjà aidé dans le passé, est à présent accusé du meutre de son camarade d'hôpital,qui a sauté par une fenêtre. 

Episode 6 : Manipulation - Act of Terror 

Un terroriste est abattu en direct à la télévision nationale après avoir été capturé. Harm en charge de la défense du Marine qui a tiré. Mais ce dernier est-il fou ou simplement patriotique? 

Episode 7 : Une voix dans la nuit - Angles 30 

Lorsqu'un pilote de chasse refuse d'abattre un avion iraquien, il affirme qu'une voix lui a ordonné de ne pas le faire. Au cours de l'enquête, il avoue à Harm qu'il s'agissait de la voix de Dieu. 

Episode 8 : Pour quelques minutes de plus - Mr. Rabb Go To Washington 

Harm assiste le gouvernement dans une audiance portant sur l'utilisation de gaz sarin pendant la guerre du Golfe. L'avocat australien Mic Brumby rejoint l'équipe du JAG. 

Episode 9 : Un passé encombrant - People Vs. Mac

Harm défend Mac lorsqu'elle et son ancien mentor et amant, sont accusés du meurtre de l'ex-mari de Mac, qui la menaçait de révéler leur passé et de détruire sa carrière. 

Episode 10 : Perdus dans le désert - The Black Jet 

Un pilote de la Navy est poursuivit pour espionnage en Iran après le crash de son jet. Mais quand Harm et Mac découvrent que l'avion est intact, ils doivent trouver un moyen de le faire sortir du pays. 

Episode 11 : Chloé - Jaggle Bells 

Pendant une tempête de neige, Bud joue les pères Noël, harm rencontre une jolie psychiatre, et Mac tente de réunir une petite fille et son père, disparu il y a longtemps. 

Episode 12 : Justice Expéditive - Dungaree Justice 

Le propriétaire d'un bar est violemment battu par trois marins qui l'accusent d'avoir violé leur collègue féminine. De son côté, le frère de Bud, pense avoir fait une erreur en s'engageant dans la Navy. 

Episode 13 : Le choix - War Stories 

Bud est en charge de sa première grande affaire, mais on lui demande soudain de renoncer. Pendant sa permission, l'Amiral s'égare du le tournage d'un film et en devient le conseiller technique. 

Episode 14 : La jungle des miroirs - Webb of Lies 

Lorsque le corps de Webb, agent de la CIA, est retrouvé à bord d'un navire en flammes, Harm découvre l'existence d'une agence d'espionnage frauduleuse, et apprend qu'un imposteur est emprisonné à la place de l'assassin qui a tenté de le supprimer à deux reprises. 

Episode 15 : La loi du talion - River's Run 

Quand la Navy SEAL tue accidentellement un garçon pendant une mission d'entraînement, les gens du village ainsi que l'oncle fugitif de la victime le traduisent devant un tribunal irrégulier. 

Episode 16 : Enquête dans le silence - Silent  Service 

De trop nombreux accidents sont survenus à bord d'un sous-marin nucléaire. Harm et Mac y mênent l'enquête, tout
en essayant de régler leurs problèmes relationnels. 

Episode 17 : L'enfant de personne - Nobody's Child

Harm se sent émotionnellement lié à une petite fille qui a été retrouvée morte sur une base navale. Il fait donc appel à une vieille amie pour l'aider à trouver l'assassin. 

Episode 18 : Dans le noir - Shakedown 

Mac et Harm soupçonnent un sabotage quand ils embarquent sur un transporteur en proie à une panne totale de courant. Quant à Bud, il réussit son examen du barreau et est promu. 

Episode 19 : Adversaires - The Adversaries

La première affaire de Bud depuis sa promotion est la défense de son propre père, accusé de vol par la Navy. Et le procureur dans cette affaire n'est autre que le Capitaine Rabb.

Episode 20 : Changer le passé - Second Sight

Harm envisage une opération des yeux qui pourrait lui permettre de voler à nouveau. Mac, de son côté, redoute la rencontre avec son père qu'elle n'a plus revu depuis longtemsp et qui est en train de mourir dans un hospice. 

Episode 21 : Hallucinations - Wilderness Of Mirrors 

Quand Harm commence à avoir des images de son père décédé, il se confie à son amie psychiatre. Pendant ce temps, l'Amiral Chegwidden se prépare à plaider devant la cour suprême. 

Episode 22 : Un vieux compagnon - Soul Searching 

Webb vient demander de l'aide à Chegwidden  pour secourir son mentor, qui a également sauvé la vie de l'Amiral. Et on a volé la corvette bien-aimée de Harm. 

Episode 23 : Et un bébé, un ! - Yeah Baby 

Son opération des yeux réussie, Harm démissionne du corps des JAG afin de voler à nouveau. Tandis que Bud plaide dans une affaire de grossesse, Harriet commence à avoir des contractions dans le bureau de l'Amiral. 

Episode 24 : Tout Recommencer - Goodbyes 

Harm se prépare à quitter ses amis du JAG, quand il découvre que l'homme qui a tué une petite fille y a plusieurs mois a refait surface, et veut s'en prendre à sa soeur. 

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